1)Po čemu je kompliciran?Nemoraš više učiti terminal da bi se njime koristio,jedino što pri eventualnim popravcima Linux experti radije ti daju komande za terminal nego tutorijale za grafičko sučelje,a o tome se može napisati poveći tekst.Ja osobno sam odrastao na Windowsu deset godina i kada sam Linux 2009. prvi puta instalirao u dual boot sa sedmicom sam se osjećao preporođen.A i možda ti se ti programi na Linuxu samo pričinjavaju lakšima jer je Open source development takav da uvijek pokušava štediti resurse računala,šta mu često i uspijeva radi zajedničkih dijeljenih libraryja(koji su teži za ostvariti u closed source developmentu).
2)Java na Linuxu baš i nije popularna.Sa time da je veći dio aplikacija sitan se slažem.
3)Prvo govoriš o običnim smrtnicima zatim govoriš o ozbiljnim programima.Obični smrtnici ne koriste ozbiljne programe.
Ako si običan smrtnik dovoljan ti je LibreOffice+Internet+Multimedia.Jednostavno jer naprednije funkcije u MS oFFiceu običan smrtnik ni nezna koristiti.
Ako si napredan korisnik(profesionalac) onda se vjerojatno ne baviš jačim sistem administrationom,network administrationom,cross platform developmentom,bilokakvom naprednijom administracijom ičega,očito nikada nisi imao ni potrebu za apache web serverom,php-om,mysql-om itd...A za te stvari na Linuxu imaš puno moćnije alate nego na drugim platformama.
Ali ajde,Linux je možda najnepristupačniji onima koji su po svojim potrebama i vještinama između dvije krajnosti profesionalaca i običnog smrtnika,nazovimo takve korisnike 'hobby entuzijastima'.Jer dok s jedne strane Linux je sistem administratorima omiljena igračka/alat.Sa druge strane posljednjih 10 godina je strašan trud u Linux zajednici uložen da bi se internet+multimedija+office usavršio(i to je dovelo do toga da imaš neka sučelja koju sa čak toliko jednostavna da se njima mogu služiti bebe i umirovljenici).Nažalost su u tom procesu oni korisnici između ostali zakinuti.Jer se razmišljalo ako nisi profesionalac evo ti internet+multimedija+office,ako jesi onda ćemo pretpostavit da znaš šta radiš i da neće biti problema.A oni korisnici koji su 'hobi entuzijasti' često rade na svim platformama stvari za profesionalce ali bez da dobro razumiju šta rade nego se pouzdaju u sučelje ili 2-3 tutorijala i drže fige da će sve biti u redu.
I ja sam nekada bio u skupini 'hobby entuzijasta',ali sada sam već 3. godina fakulteta i smijem se na činjenicu da sam nekada mislio da znam znanje ako sam u fps creatoru drag and droppao stvari po ekranu,znao defragmentirati disk ili znao koja je grafička bolja od koje.
A ako si jedan od onih grafičara koji adobe smatra 'bogom i batinom' onda jednostavno nemaš sreće.Zaboravi sada na gimp i blender ali ima gomilu drugih alata koji su portani na Linux a koji su sasvim dobri.Evo ti manji dio od svega šta možeš koristiti kao zamjenu za Adobeov software na Linuxu:
http://www.pixelprospector.com/the-big-list-of-graphics-programs-linux-edition/
http://en.wikipedia.org/wiki/Autodesk_Maya
https://www.linux.com/news/software/applications/692381-professional-graphics-creation-on-linux
http://www.linuxlinks.com/article/2008091312364896/Graphics.html
...itd...
Iako ja osobno koristio bi alternative za adobe i na Windowsima.
Edit:Vidim ove nove poruke.Ma imaš dosta toga,ali zašto se mučiš.Za većinu programa je Linux instalacija lakša od Windows instalacije.Samo uđeš u software centar,potražiš i napraviš one click instalaciju.Pod 'port' se misli da ima verzija te aplikacije za Linux.Mislim da matlab imaš u software centru.