Nije ni logika problem, nego polazna točka. Matrix vjeruje u nadnaravne moći Isusa jer je krenuo s točke u kojoj su te moći moguće i opravdane polaznom točkom (Bogom). Stvar se komplicira u tome što je jedino jedna strana u pravu. Ovdje ne bi trebalo ni biti ono "slobodno vjeruj u što želiš", već bi se ovo trebalo razriješiti. Što duže ustrajemo u toj slobodi mišljenja kako je svijet i život nastao, to ćemo sporije evoluirati kao vrsta. Ukoliko nema niti jednog pokazatelja da su njegova čuda i nadnaravne osobine moguće, pošto, kao što matrix kaže, ne možemo dokazati postojanje ili nepostojanje Boga (ja smatram da možemo, ali ok), onda tu polaznu točku možemo odbaciti kao neosnovanu. Ukoliko se ne može, sa sigurnošću, temelj te polazne točke utvrditi kao stvaran, onda nema smisla da ta polazna točka bude polazna točka za stvarnost. Ukoliko ju uzmemo kao stvarnost, ionako će se kasnije svejedno dokazati netočnom tj nestvarnom, uslijed tvrdnji koje su downright netočne a slijede iz te točke (kreacionizam, veliki potop itd). Biblija te bilo koja druga vjerska knjiga ne može biti dokaz za išta, pošto dokaz mora biti nepristran, a vjerske knjige su itekako pristrane određenim stranama, sve uključuju neku vrstu božanstva.
Imamo polaznu točku koja daje rezultate i iz te polazne točke dobivamo objašnjenja kako naš svemir funkcionira, kako smo nastali, što se nalazi van našeg svijeta itd. Ta polazna točka, koja jedina ima dokaze iza sebe, bi trebala biti jedina polazna točka.
Vjerojatnost postojanja Boga skoro je ravna nuli, a smanjivala se razvojem znanosti, te će se izravnati s nulom, po mom mišljenju, vrlo brzo.